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Agrupadas en su mayoría en la Asociación de Sociedades Científicas Médicas de Chile, estas organizaciones propenden a fomentar la creación del conocimiento y al establecimiento de vínculos académicos entre sus miembros, lo cual tributa tanto al mayor desarrollo de los especialistas como a mejorar la salud de la población nacional.
Las sociedades cuyas presidencias y vicepresidencias son cargos cubiertos por académicos de la Facultad de Medicina y pertenecientes a sus diferentes campus clínicos son:
- Dr. Jaime Escobar, HCUCH, presidente de la Sociedad de Anestesiología de Chile.
- Dr. Juan Carlos Prieto, ICBM, vicepresidente de la Sociedad Chilena de Cardiología y Cirugía Cardiovascular.
- Dra. Montserrat Fontbona, prof. Agregada de la Facultad de Medicina, presidente de la Sociedad Chilena de Cirugía Plástica
- Dr. Nelson Navarrete, director académico Campus Sur, presidente Sociedad Chilena de Dermatología y Venereología.
- Dra. Hilda Rojas, HCUCH, vicepresidenta de la Sociedad Chilena de Dermatología y Venereología.
- Dr. Francisco Mendoza, Instituto Nacional del Tórax, presidente de la Sociedad Chilena de Enfermedades Respiratorias.
- Dra. Laura Mendoza, vicepresidente de la Sociedad Chilena de Enfermedades Respiratorias.
- Dr. Pedro Pineda, HCUCH, vicepresidente de la Sociedad Chilena de Endocrinología y Diabetes
- Dr. Gerardo Fasce, HCUCH, vicepresidente de la Sociedad de Geriatría y Gerontología de Chile
- Dr. Carlos Romero, HCUCH, presidente de la Sociedad Chilena de Medicina Intensiva
- Dr. Rubén Torres, HCUCH, vicepresidente de la Sociedad Chilena de Nefrología
- Dr. Luis Risco, Clínica Psiquiátrica Universitaria, presidente de la Sociedad de Neurología, Psiquiatría y Neurocirugía.
- Dr. Omar Nazzal, Dpto. Obstetricia y Ginecología Centro, presidente de la Sociedad Chilena de Obstetricia y Ginecología.
- Dr. Carlos Stott, HCUCH, presidente de la Sociedad Chilena de Otorrinolaringología.
- Dra. Annelise Goecke HCUCH, presidente de la Sociedad Chilena de Reumatología
- Dr. Tomás Olmedo, HCUCH, vicepresidente de la Sociedad Chilena de Urología
- Dr. Marcelo Llancqueo, HCUCH, vicepresidente de la Sociedad Médica de Santiago.
- Dra. Karin Papapietro, HCUCH, vicepresidente de la Asociación Chilena de Nutrición Clínica, Obesidad y Metabolismo.
- Dra. Cecilia Toro, Vicepresidenta Sociedad de Microbiología de Chile